Una vez el doctorando haya sido admitido en el Programa, haya completado satisfactoriamente el proceso de matriculación y la Comisión Académica le haya comunicado la Comisión de Seguimiento que le ha sido asignada, deberá proceder a la presentación de su Proyecto de Investigación.
El Proyecto de Investigación es un informe que el doctorando debe presentar a la Comisión de Seguimiento, con el beneplácito del Director de Tesis, a lo largo del mes de enero o de mayo dependiendo de si la admisión al Programa se ha realizado en los periodos de Otoño o Primavera respectivamente. El Proyecto de Investigación debe indicar el nombre del doctorando, del director y del tutor en el caso de que lo haya, la línia de investigación en la que se inscribe la Tesis, una propuesta de título, una breve memoria sobre el tema de trabajo, los objetivos de la investigación, la metodología de trabajo así como una planificación temporal y, si es preciso, una descripción de los posibles resultados preliminares ya obtenidos que puedan ilustrar la línea que se pretende seguir.
A la vista del Proyecto de Investigación presentado, la Comisión de Seguimento emitirá un breve informe sobre su idoneidad. Si el informe es favorable, el doctorando tendrá que entregarlo a la Secretaría del Departament de Química Orgànica junto con una solicitud que puede obtenerse en la Secretaría de la Facultat de Química y que previamente habrá presentado en el Registro Oficial de la Facultad de Química. Para códigos UNESCO consultar Areas y Materias.
A la vista del informe de la Comisión de Seguimiento y de la solicitud presentada, el Presidente de la Comisión Académica del Programa la firmará y la secretaria del Programa abrirá una carpeta de actividades personalizada que recogerá las actividades de formación en que intervenga el doctorando. El doctorando recogerá la solicitud debidamente firmada y la presentará en la Secretaría de la Facultad. En este momento empieza la Tesis Doctoral.
Paralelamente, el doctorando entregará en la Secretaría del Programa un documento de confidencialidad firmado por cada miembro de la Comisión de Seguimiento.
Si el informe es negativo, el doctorando dispone de seis meses para reelaborarlo de acuerdo con las indicaciones y sugerencias de la Comisión de Seguimiento.